二代保險費 = 一般保險費 ＋ 補充保險費

即將在102年1月1日實施的二代健保，究竟與現行所實施的一代健保制度有何差異呢？
一代健保的保費計算方式為 :
被保險人 : 投保金額×保險費率（5.17%）× 負擔比率 × (1+眷口數)
例： 53,000 ×5.17% ×30% ×（1+2）＝2,466

雇主負擔 : 投保金額 × 保險費率（5.17%）× 負擔比率 ×（1+平均眷口數）
例： 53,000 ×5.17% ×10% ×（1+0.7）＝466

此次健保改革的核心價值在於品質、公平、效率，以擴大保險費費基，使保費負擔更公平，強化量能負擔之精神，二代健保保費除了原有的一般保費之外，針對雇主一項及保險對象六項特定項目扣取補充保險費， 被保險人發生下列六項特定項目所得時，應於給付時按補充保險費率2%扣取補充保險費:

1. 所屬投保單位給付全年累計4個月以上之獎金
2. 非所屬投保單位之薪資所得
3. 執行業務收入
4. 股利所得
5. 利息所得
6. 租金收入

˙雇主每月須繳納之補充保費為 (支付薪資總額-受雇員工投保金額總額) × 補充保費之費率（2%）

而被保險人免扣取補充保費之範圍如下

1. 單次給付金額逾新臺幣一千萬元之部分
2. 單次給付金額未達一定金額者
3. 獎金：全年未超過投保金額4倍之部分
4. 第二類被保險人之薪資所得
5. 依第二十條規定以執行業務所得為投保金額者之執行業務收入（例：自行執業之律師、會計師等）
6. 已列入投保金額計算保險費之股利所得
7. 未滿18歲、中低收入戶及符合健保法所定經濟困難者，未達基本工資之兼職所得。

二代健保補充保費如何計算 ?

　　我們先以保險對象的六項特定所得 (收入)中的第1點來說明個人補充保費的計算，所謂 [獎金] 的定義為符合所得稅法第14條第1項第3類規定應納入薪資所得項目，且未列入投保金額計算之具獎勵性質之各項給予，如年終獎金、節金、紅利等(扣繳辦法草案§3)，採當年度1月1日起算累計超過4倍投保金額之獎金，則需以單次給付獎金金額與累計超過4倍投保金額之獎金比較，以較小之金額為獎金的費基，用下圖案例來做說明。

　　而第2~5點所指之所得 (收入)的補充保費計收方式為各項補充保險費之所得 (收入) 金額×補充保險費率2%，補充保險費係由扣費義務人於「當次」給付時扣取，均非採事後累計。

　　那麼雇主 (投保單位) 補充保險費收繳方式為投保單位(即雇主)每月所支付薪資總額(所得稅格式代號50)與其受僱者每月投保金額總額間的差額，應按費率2%自行計算補充保險費後，併同一般保險費應負擔之保險費，按月繳納。